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circRNA研究汇总 | 20200824-0830
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2020-08-31 | 99 次浏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道彙總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻共計41篇,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。

檢索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]



1、CircRNA通過與宿主基因相互作用抑制DNA損傷修複。

標題:CircRNA inhibits DNA damage repair by interacting with host gene.

雜志:Mol Cancer

影響因子:15.302

通訊作者:Ke Chen (武汉同济医院), 何春江和魏蕾(武汉大学基础医学院)


环状RNA(circRNA)失调与癌症的发展和治疗耐药性密切相关。但是,目前circRNA的功能研究主要集中在其潜在的miRNA或蛋白质结合上,探讨circRNA对宿主基因DNA的更多潜在调节作用非常必要。该研究首先对临床乳腺癌样品进行了总RNA测序,并鉴定了circRNA和相应宿主基因在患者血液,肿瘤和邻近正常组织中的表达模式。使用qPCR,northern blot和原位杂交实验验证到circRNA——circSMARCA5的失调。进行了R-loop斑点印迹,DNA-RNA免疫沉淀和质谱分析等一系列实验探索circSMARCA5对SMARCA5的15号外显子转录的调控。研究结果发现circRNA在外周血中比其宿主线性基因平均表达更高。与邻近的正常组织相比,乳腺癌组织中的circSMARCA5减少,与宿主基因SMARCA5相反。circSMARCA5的过表达在体外和体内均可诱导乳腺癌细胞株的药物敏感性。此外,研究者还证明circSMARCA5可以与其亲本基因座结合,形成一个R-loop环,从而导致SMARCA5的15号外显子的转录暂停。CircSMARCA5的表达导致SMARCA5的下调和截短的非功能蛋白的产生,而circSMARCA5的过表达足以提高对细胞毒性药物的敏感性。该研究结果揭示了circRNA在其宿主基因上的新调控机制,并提供了证据表明circSMARCA5可以作为耐药性乳腺癌患者的治疗靶标。


圖注:CircSMARCA5表達調控其親本基因SMARCA5下調的作用機制模式圖


2、環狀RNA:大腦轉錄組的閃閃發光的一類分子。

標題:Circular RNAs: The Brain Transcriptome Comes Full Circle.

雜志:Trends Neurosci

影響因子:12.891

通訊作者:Irina Voineagu(新南威尔士大学)


環狀RNA(circRNA)是一類RNA分子,具有通過外顯子-外顯子的反向剪接形成的共價閉環結構。多真核物種保守性,通常具有細胞類型和組織類型的特異性表達,circRNA的這些特征已經激發了人們對circRNA生物形成及其潛在功能的興趣。circRNA在大腦中富集,並在神經元分化和去極化時積累,這表明這些RNA是大腦轉錄組的組成部分,並可能發揮功能。在這篇綜述中,作者概述了對circRNA的生物形成和功能的當前研究進展,討論了circRNA如何促進大腦中轉錄組的複雜性,並討論了關于circRNA在大腦中的功能作用的最新數據。作者還討論了關于circRNA在腦部疾病中的新興的作用,探討解決死後人類大腦中circRNA定量的常見挑戰等問題。


3、MNDR v3.0:注释信息覆盖和收录更全面的哺乳动物ncRNA疾病数据库。

標題:MNDR v3.0: mammal ncRNA-disease repository with increased coverage and annotation.

雜志:Nucleic Acids Res 

影響因子:11.501

通訊作者:王棟教授(南方醫科大學)


许多研究表明,非编码RNA(ncRNA)功能障碍与多种疾病密切相关。最近,ncRNA-疾病关联研究数据积累非常迅速,原有的相关数据库记录的数据慢慢不能满足现有生物医学研究的需求,因此ncRNA疾病数据库的不断更新已变得至关重要。研究者已将哺乳动物ncRNA疾病信息库(MNDR,http://www.rna-society.org/mndr/)更新为3.0版。MNDR(哺乳动物ncRNA-疾病存储库)主要存储和管理ncRNA与疾病之间的关联一个数据库。MNDR数据库开发者通过人工整合从文献和其他资源中精选的实验支持和预测的ncRNA疾病关联数据,此次更新到最新版3.0版。MNDR v3.0包含超过一百万个ncRNA疾病条目,包括6,300多种miRNA,39,880个lncRNA,20,256个circRNA,10,894个piRNA和521个snoRNA,覆盖1,600多种疾病和11种哺乳动物。与以前的数据相比,此次更新数据增加了四倍。整合了实验性和预测性的circRNA疾病关联数据。此外,增加了ncRNA疾病相关的药物注释以及ncRNA亚细胞定位和相互作用,还提供了三种ncRNA疾病(miRNA/lncRNA/circRNA)预测工具,并且对网站也进行了优化,使其更加实用和用户友好。总而言之,MNDR v3.0将是用于研究疾病机制和临床治疗策略的宝贵资源。


图注:MNDR v3.0数据库网址:http://www.rna-society.org/mndr/



參考文獻列表