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RNA sequencing
小RNA測序
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2017-09-02 | 7698 次浏覽 | 分享到:


        
RNA是指一類高度保守的長度爲18-32nt的RNA分子,主要包括miRNAsiRNAsnoRNApiRNA等,是生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。近年來, 由于小RNA測序技術的應用,越來越多的miRNA被發現和功能鑒定,並將廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預後等領域。

技術路線


樣品要求

        樣品類型:細胞、新鮮組織FFPE組織、血液RNA、血清血漿RNA外泌體RNA樣品等。

        物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)

        具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

 

測序方案

        測序模式 PE150

        測序數據量 10M reads

生物信息分析內容

        1 miRNA測序分析

        2 原始數據質控檢查;

        3 比對結果質控檢查

        4 miRNA預測

        5 ncRNA注釋(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA

        6 基于miRNA表達的樣品主成分分析

        7 miRNA差異分析

        8 差異miRNA靶基因GO功能分析

        9 差異miRNA靶基因通路分析

        10 差異miRNA与差異表达基因调控分析(如果有mRNA測序結果)

        11 差異miRNA与差異表达基因网络绘图(如果有mRNA測序結果)




高通量測序?