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RNA sequencing
微量RNA測序
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2017-09-02 | 8968 次浏覽 | 分享到:


        目前,常规高通量測序建库对樣品量的要求较高,许多来源稀少的细胞樣品、
exosome樣品、腫瘤等臨床樣品以及一些提取困難、容易降解的特殊樣品等由于難以獲得足量的核酸而無法進行常規建庫測序。吉賽生物在豐富的核酸抽提經驗的基礎上,結合領先的文庫構建策略,同時推出微量RNA(<10ng)測序,爲客戶提供更全面的測序服務和更專業的數據分析報告。

技術路線

 



樣本要求

        樣品類型:微量RNA樣品

        物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)

        具体樣品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。

測序方案

        測序模式 PE150

        測序數據量 10Gb

生物信息分析內容

基礎分析  

        1 原始數據質控檢查

        2 比對結果質控檢查

        3 基于基因表达的樣品主成分分析

        4 差異基因表達及相關通路富集分析

        5 circRNA預測及鑒定

        6 circRNA差異分析

        7 差異circRNA宿主基因的通路富集分析

        8 差異circRNA的靶向miRNA預測分析

        9 長鏈非編碼RNA差異分析

 

高級分析 

        10 基于基因表達的通路活性分析  

        11 轉錄調控活性分析及通路互作分析

        12 差異長鏈非編碼RNA的調控基因的通路富集分析

        13 circRNA及靶向miRNA網絡調控制圖

高通量測序?