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circRNA研究汇总 | 20191230-0105
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2020-01-06 | 215 次浏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道彙總”欄目,本期從pubmed中檢索(收集最新發布的circRNA文獻共計25,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。

檢索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 




1、環狀RNA的准確定量及識別廣泛的環狀RNA可變剪切事件。


標題:Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events.

雜志:Nature Communications

IF:11.878

通訊作者:趙方慶(中國科學院北京生命科學研究院)


环状RNA(circRNA)的检测和定量面临若干重大挑战,包括较高的错误发现率,rRNA去除和RNase R处理效率不均匀性,以及反向剪接读数可能被低估。该研究中,研究者提出了一种新颖的算法——CIRIquant,用于circRNA的精确定量和差异表达分析。通过构建伪circRNA参考组重新排列RNA-seq读段,并采用复杂的统计模型来纠正RNase R处理偏倚,CIRIquant可以为circRNA提供更准确的表达值,并显著降低错误发现率。研究者进一步开发了实施两种独立措施的一站式差异表达分析流程,有助于揭示circRNA及其线性对应转录本之间竞争性剪接的调控。CIRIquant在处理肝细胞癌的RNA-seq数据集中,可表征circRNA转录组及其对应线性转录组之间竞争性剪切关系,表明CIRIquant在探索肝脏肿瘤发生中广泛的转录组变化能力方面表现突出。



圖注:CIRIquant分析流程示意圖


2、大腸癌中外泌體傳遞的circRNA通過miR-122-PKM2軸促進糖酵解並誘導化療抗性。


標題:Exosome-delivered circRNA promotes glycolysis to induce chemoresistance through the miR-122-PKM2 axis in colorectal cancer.

雜志:Molecular Oncology

IF:5.962

通訊作者:巴一 和 应国光(天津醫科大學附屬腫瘤醫院)


大肠癌(CRC)及其其他恶性肿瘤通常依靠有氧糖酵解来产生ATP,以实现快速生长和化疗耐药性。丙酮酸激酶(PKM2)的M2同工酶在催化糖酵解中起关键作用,PKM2的表达甚至在同一肿瘤内也会发生变化。在这项研究中,研究者证实PKM2在CRC细胞中的表达是异质的,即在奥沙利铂抗性细胞中较高,而在敏感细胞中相对较低,并且发现化疗抗性细胞糖酵解和ATP产生增强。并且发现此为一种依赖PKM2的化疗耐药机制,通过该机制,化疗敏感性细胞可能逐渐转化为化疗抗性细胞。环状RNA hsa_circ_0005963(在该研究中称为ciRS-122),被确定为靶向PKM2的miRNA-122的海绵,与化疗抗性呈正相关。体外和体内研究表明,来自奥沙利铂抗性细胞的外泌体将ciRS-122传递至敏感细胞,从而通过海綿吸附miR-122和上调PKM2促进糖酵解和耐药性。此外,外泌体转运的si-ciRS-122可通过调节体内的ciRS-122-miR-122-PKM2途径抑制糖酵解并逆转CRC细胞对奥沙利铂的耐药性。源自化疗抗性CRC细胞的外泌体可以跨细胞转移ciRS-122并促进糖酵解,从而降低化疗敏感性细胞中的药物敏感性。这种细胞间信号传递暗示了潜在的新型治疗靶点,并为耐药性CRC的未来临床应用奠定了基础。



圖注:小鼠尾靜脈注射exo-si-ciRS-122可在體內導致SW480細胞對奧沙利鉑(L-OHP)的敏感性。


3、环状RNA circSLC26A4通过miR-1287-5p / HOXA7轴加速宫颈癌的进展。


標題:Circular RNA circSLC26A4 Accelerates Cervical Cancer Progression via miR-1287-5p/HOXA7 Axis.

雜志:Molecular Therapy-nucleic Acids

IF:5.919

通訊作者:朱元方(暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院);罗新 (暨南大学附属第一医院妇产科);丁岩(新疆医科大学第一附属医院)


该研究关注circRNA在宫颈癌中的作用及生物形成。研究者鉴定出一种新型的circRNA,circSLC26A4在宫颈癌组织和细胞中显著上调。在临床上,circSLC26A4的高表达与宫颈癌患者生存率低有关。细胞功能上,circSLC26A4敲低抑制了体外和体内宫颈癌细胞的增殖,侵袭和肿瘤生长。此外,circSLC26A4充当miR-1287-5p的海绵;而miR-1287-5p靶向HOXA7 mRNA的3'UTR。此外,RNA结合蛋白(RBP)——QKI被确定与SLC26A4基因内含子中的QKI反应元件(QREs)相互作用,从而促进circSLC26A4生物形成。这些发现表明,circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展,这可能为宫颈癌带来新的治疗策略。


图注:circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展示意图



參考文獻列表:

序號

主要內容

论文標題

雜志

IF

單位

1

環狀RNA的准確定量及識別廣泛的環狀RNA可變剪切事件。

Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events.

Nat Commun

11.878

中國科學院北京生命科學研究院

2

大腸癌中外泌體傳遞的circRNA通過miR-122-PKM2軸促進糖酵解並誘導化療抗性。

Exosome-delivered circRNA promotes glycolysis to induce chemoresistance through the miR-122-PKM2 axis in colorectal cancer.

Mol Oncol

5.962

天津醫科大學附屬腫瘤醫院

3

环状RNA circSLC26A4通过miR-1287-5p / HOXA7轴加速宫颈癌的进展。

Circular RNA circSLC26A4 Accelerates Cervical Cancer Progression via miR-1287-5p/HOXA7 Axis.

Mol Ther Nucleic Acids

5.919

暨南大學附屬深圳市寶安區婦幼保健院等

4

CircNFIX通過調節miR-378e/RPN2軸促進神經膠質瘤的進展。

CircNFIX promotes progression of glioma through regulating miR-378e/RPN2 axis.

J Exp Clin Cancer Res

5.646

福建醫科大學附屬第一醫院

5

环状RNA SMO通过海綿吸附miR-338-3p增強SMO的表達,促進神經膠質瘤的生長。

Circular RNA SMO sponges miR-338-3p to promote the growth of glioma by enhancing the expression of SMO.

Aging (Albany NY)

5.515

華中科技大學同濟醫學院

6

环状RNA circ_0003204通过miR-370-3p/TGFβR2/phospho-SMAD3轴抑制动脉粥样硬化中内皮细胞的增殖,迁移和管形成。

Circular RNA circ_0003204 inhibits proliferation, migration and tube formation of endothelial cell in atherosclerosis via miR-370-3p/TGFβR2/phosph-SMAD3 axis.

J Biomed Sci

5.203

山東第一醫科大學第一附屬醫院

7

從缺氧預處理的心肌細胞中釋放的外泌體circHIPK3通過miR-29a/IGF-1途徑調節心髒微血管內皮細胞的氧化損傷。

Exosomal circHIPK3 Released from Hypoxia-Pretreated Cardiomyocytes Regulates Oxidative Damage in Cardiac Microvascular Endothelial Cells via the miR-29a/IGF-1 Pathway.

Oxid Med Cell Longev

4.868

遵義醫科大學附屬醫院

8

綜述:破譯環狀RNA在神經退行性疾病中的作用。

Going around in circles: deciphering the role of circular RNAs in neurodegenerative disease.

Curr Opin Psychiatry

4.483

新南威爾士大學

9

環狀RNAs是心髒纖維化中潛在的治療療法。

Circular RNAs as potential theranostics in the cardiac fibrosis.

Heart Fail Rev

4.015

塔比亞特莫達雷斯大學

10

血清環狀RNA充當肥厚性梗阻性心肌病的血液生物標記。

Serum circular RNAs act as blood-based biomarkers for hypertrophic obstructive cardiomyopathy.

Sci Rep

4.011

漢諾威漢諾威醫學院

11

敲低环状RNA circZNF652可通过调节miR-181a减轻LPS诱导的炎症损伤。

Knockdown of circular RNA circZNF652 remits LPS-induced inflammatory damage by regulating miR-181a.

Biofactors

3.598

濟甯市婦幼保健計劃生育服務中心

12

新型环状RNA circFN1通过海綿吸附miR-182-5p增強胃癌的順鉑耐藥性。

A novel circular RNA circFN1 enhances cisplatin resistance in gastric cancer via sponging miR-182-5p.

J Cell Biochem

3.448

皖南醫學院弋矶山醫院

13

环状RNA ACR通过降低microRNA-145-3p减轻了葡萄糖引起的RSC96细胞凋亡和自噬。

Circular RNA ACR relieves high glucose-aroused RSC96 cell apoptosis and autophagy via declining microRNA-145-3p.

J Cell Biochem

3.448

菏澤市立醫院

14

直腸癌細胞系中环状RNA circMTO1通过下调miR-19b-3p充当抗肿瘤因子。

Circular RNA circMTO1 acts as an antitumor factor in rectal cancer cell lines by downregulation of miR-19b-3p.

J Cell Biochem

3.448

濟甯醫學院附屬醫院

15

circSMAD2通過抑制microRNA-9來控制遷移和上皮-間質轉化。

circSMAD2 governs migration and epithelial-mesenchymal transition by inhibiting microRNA-9.

J Cell Biochem

3.448

吉林大學中日聯合醫院

16

环状RNA ABCB10通过使miR-670-3p海绵化来增加HMG20A表达,从而促进肝癌的进展。

Circular RNA ABCB10 promotes hepatocellular carcinoma progression by increasing HMG20A expression by sponging miR-670-3p.

Cancer Cell Int

3.439

吉林大學第一醫院

17

新型环状RNA circ-CAMK2A通过调节miR-615-5p /纤连蛋白1途径来增强肺腺癌的转移。

The novel circular RNA circ-CAMK2A enhances lung adenocarcinoma metastasis by regulating the miR-615-5p/fibronectin 1 pathway.

Cell Mol Biol Lett

3.367

河南省胸科醫院

18

環形RNA_LARP4通過海綿化miR-1323调节PTEN/ PI3K/AKT途径,阻碍食管鳞状细胞癌的进展。

Circular RNA_LARP4 Sponges miR-1323 and Hampers Progression of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through Modulating PTEN/PI3K/AKT Pathway.

Dig Dis Sci

2.937

南通大學附屬醫院

19

基于MetaDE的胃癌circRNA表達譜分析。

MetaDE-Based Analysis of circRNA Expression Profiles Involved in Gastric Cancer.

Dig Dis Sci

2.937

中國醫科大學附屬第一醫院

20

环形RNA_101237通过靶向心肌细胞中的let-7a-5p / IGF2BP3介导缺氧/复氧损伤。

Circular RNA_101237 mediates anoxia/reoxygenation injury by targeting let7a5p/IGF2BP3 in cardiomyocytes.

Int J Mol Med

2.928

廣西壯族自治區人民醫院

21

玉米中環狀RNA的鑒定,表征和功能預測。

Identification, characterization, and functional prediction of circular RNAs in maize.

Mol Genet Genomics

2.879

浙江大學作物科學研究所

22

氯胺酮誘導的大鼠海馬中rno_circRNA_014900和rno_circRNA_005442的異常表達。

Abnormal expression of rno_circRNA_014900 and rno_circRNA_005442 induced by ketamine in the rat hippocampus.

BMC Psychiatry

2.666

阿拉巴馬大學伯明翰分校

23

與肝細胞癌相關的環狀RNA相關的ceRNA網絡的生物信息學分析。

Bioinformatic Analysis of Circular RNA-Associated ceRNA Network Associated with Hepatocellular Carcinoma.

Biomed Res Int

2.197

吉林大學第二醫院

24

Circ_MDM2_000139,Circ_ATF2_001418,Circ_CDC25C_002079和Circ_BIRC6_001271參與XAV939在非小細胞肺癌中的功能。

Circ_MDM2_000139, Circ_ATF2_001418, Circ_CDC25C_002079, and Circ_BIRC6_001271 Are Involved in the Functions of XAV939 in Non-Small Cell Lung Cancer.

Can Respir J

1.803

吉林大學中日聯合醫院

25

前列腺癌上皮-間充質轉化相關circRNA和miRNA的篩選和鑒定。

Screening and identification of epithelial-to-mesenchymal transition-related circRNA and miRNA in prostate cancer.

Pathol Res Pract

1.794

廈門大學中山醫院